Взятие отделяемого из конъюнктивальной полости или участков воспаления придаточного аппарата глаза осуществляет специально обученные медицинские работники (врачофтальмолог или лаборант клинико-бактериологической лаборатории). Материал для исследования берут с помощью стерильных ватных тампонов, одноразовых и многоразовых микробиологических петель и т.д. (рис. 6). При эндофтальмите забор материала для исследования (содержимое передней камеры, фрагменты стекловидного тела, ИОЛ) осуществляет офтальмохирург. Материал следует сеять на питательные среды непосредственно во время приема в кабинете врача или в процедурном кабинете, у постели больного или во время операции и т.д. Накануне (как минимум за 6-8 ч до исследования) желательно отменить прием всех медикаментов и процедур, назначенных больному. Транспортировку материала для исследования в бактериологическую лабораторию осуществляют в предельно сжатые сроки (не позднее 3 ч). Более длительное хранение может привести к гибели возбудителей или изменению количественных соотношений частей микрофлоры. Поэтому в случаях, когда хранение и транспортировка длятся более длительное время, используют консервант или транспортные (поддерживающие, накопительные) среды, сохраняющие жизнедеятельность микроорганизмов. Следует учитывать, что применение транспортной среды увеличивает срок выдач окончательного ответа на одни сутки.

При наличии специфических клинических проявлений инфекционно-воспалительного процесса необходимо выполнить соскоб с поверхности конъюнктивы или роговицы для выявления вирусов, хламидий, грибов или акантамеб. Взятие проб при конъюнктивитах, блефароконъюнктивитах, кератитах, эндофтальмитах, орбитальных целлюлитах, дакриоаденитах, дакриоциститах, каналикулитах и других воспалительных заболеваниях глаз проводят по стандартным методикам, изложенным в различных методических указаниях и руководствах [3, 7-9].